過去的一年,蛋白質組學在研究和臨床上都取得了蓬勃發(fā)展,華大基因蛋白質組學也始終以提供更優(yōu)質的科技服務為目標,不斷提升產品水平和質量,在今年完成了蛋白定量類全線產品優(yōu)化升級,蛋白修飾類產品整體質量提升,并推出空間蛋白質組等多項新產品助力前沿科學研究。 現(xiàn)在,邀您一同回顧我們不斷前進的科研印記!
NO.1蛋白定量類全線產品優(yōu)化升級
蛋白質組定量可以對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行精確鑒定和定量,用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白質,結合生物信息學分析揭示生命體生理病理功能,同時也可對某些關鍵蛋白質進行定性和定量分析,是目前蛋白質組學研究最重要的方向之一。
華大科技蛋白定量在今年全面優(yōu)化升級,推出多項新產品和新服務、數(shù)據(jù)分析能力全面提升,從高通量數(shù)據(jù)到高效率分析全覆蓋,進一步助力數(shù)據(jù)深度挖掘。
1. 標記蛋白定量,檢測通量再升級
IBTpro-16plex和TMTpro-18plex全新升級,可分別同時對多達16例和18例樣品進行蛋白定量,進一步助力定量多元化。此類產品也適用于磷酸化蛋白定量。
2. 非標記DDA和DIA等蛋白定量產品信息分析全面升級
新增多條質控內容、結果目錄一目了然、報告展示結構優(yōu)化,提供更加人性化的分析報告及結果。
3. 新增及升級多項高級分析和多組學關聯(lián)分析服務
機器學習:不基于任何假設直接從數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)分子間內在規(guī)律,有助于更好地理解疾病發(fā)生、發(fā)展的復雜機制,是精準醫(yī)療領域的一個重要工具。
GSEA、WGCNA:從海量數(shù)據(jù)中挖掘與生物學意義相關的蛋白,識別已知蛋白的新功能、尋找新調控蛋白,深入了解調控機制。
蛋白-代謝多組學關聯(lián)分析:從“因”和“果”探究生物學問題,相互間進行驗證,進而深入開展后續(xù)研究與應用,全面了解生物系統(tǒng)調控機制。
NO.2蛋白修飾類產品整體質量提升
許多蛋白質是在發(fā)生翻譯后修飾起作用的。以人體為例,50%以上蛋白質發(fā)生蛋白翻譯后修飾(PTM),其在細胞生物過程中起看重要的調節(jié)調控作用,蛋白修飾類研究對闡釋細胞生理過程、疾病的發(fā)生發(fā)展機制都具有重要意義。今年,華大科技蛋白修飾類產品整體質量提升,實現(xiàn)富集效率、檢測通量、鑒定深度、準確度等全面優(yōu)化升級。
1. 4D-DIA磷酸化蛋白質組通量、鑒定數(shù)等多維提升
全新流程提升富集效率,自動化移液工作站提升檢測通量,縮短周期,同時降低批次效應,鑒定深度、定量準確性均有大幅提升,腫瘤組織1h鑒定磷酸化肽段達15,000+,水稻苗11,000+,同時和定量蛋白質組學強強聯(lián)合,多組學關聯(lián)分析探索蛋白質表達“全景圖”。
2. 乙?；鞍踪|組、泛素化蛋白質組富集效率、鑒定數(shù)全面提升
采用進口金標抗體,高效富集修飾肽段,4D label-free方法進行蛋白定量,提高了離子利用率和鑒定準確度,以更少上樣量、更快掃描速度,全面提升蛋白質組學的覆蓋深度、靈敏度、通量。
3. 糖基化修飾蛋白質組推出N-連接完整糖肽產品,實現(xiàn)新突破
具有更高鑒定深度的同時,可以獲得糖鏈、糖基化修飾肽段及糖鏈和糖基化位點的對應關系,并對糖鏈結構進行精確解析,一步到位,為蛋白糖基化研究提供更全面的解決方案。
NO.3新增多項前沿蛋白質組學服務
空間組學被Nature評為2022年7大“顛覆性”技術之一,蛋白質是生命活動的執(zhí)行者,在組織空間層面進行蛋白質組研究,對于解析組織微環(huán)境、診斷及預后、以及精準醫(yī)療具有重要的價值。華大科技蛋白質組緊跟國際前沿研究趨勢,于今年推出了空間蛋白質組學助力空間維度的探索。同時,還推出了Olink蛋白質組學和單克隆抗體蛋白從頭測序服務,進一步豐富蛋白質組解決方案,為廣大用戶提供更加多樣化的選擇!
1. 空間蛋白質組學
常規(guī)蛋白質組學從整個組織或數(shù)百萬細胞入手,得到的是一群細胞中信號的平均值,缺少細胞的空間信息,通過測量空間維度蛋白質組數(shù)據(jù),將能更準確地反映特定的細胞功能和狀態(tài)。
華大科技質譜平臺在空間蛋白領域深耕多年,連續(xù)發(fā)表了胃印戒癌和結直腸癌空間蛋白質組相關文章,今年重磅推出空間蛋白組學產品,提供從組織切片、到LCM切割、質譜上機、信息分析的全流程服務,專業(yè)博士團隊全程指導,采用timsTOF Pro高性能質譜儀進行檢測,在鑒定深度、定量穩(wěn)定性和準確性方面均表現(xiàn)優(yōu)異。
2. Olink蛋白質組學
Olink蛋白質組學提供所有靶向panel蛋白質組學檢測,可以廣泛應用在心血管、腫瘤、神經系統(tǒng)、免疫等疾病研究領域,提供超靈敏、無偏、靶向蛋白組學解決方案,尤其適用于大隊列疾病研究!
3. 單克隆抗體蛋白從頭測序
基于質譜的蛋白質從頭測序技術,無需數(shù)據(jù)庫、無需參考序列,僅提供少量的純化蛋白,即可獲得完整的蛋白質序列信息。為了滿足廣大科研工作者對蛋白質測序的強烈需求,華大科技蛋白質組在今年推出蛋白從頭測序服務,并針對抗體研發(fā)相關領域,特別推出單克隆抗體蛋白從頭測序(簡稱“單抗測序”)服務。
NO.4代表性文章
在過去的一年中,我們參與的蛋白組科研工作百花齊放、碩果累累,多篇文章發(fā)表于SCI核心期刊,現(xiàn)選取兩篇代表性文章與各位老師分享
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